Funktionaliteten för flermålsoptimering (MCO) syftar till att göra dosplaneringsprocessen mer inuitiv och effektiv samt erbjuder verktyg för att undersöka de kompromisser som alltid finns i en dosplan. MCO tar bort behovet av att behöva specificera vikter för olika organ i målfunktionen och även processen med att iterativt förändra dessa vikter. Istället för att vara tvungen att genomföra en serie optimeringar för att hitta rätt balans mellan olika mål kan användaren utforska lösningsrymden i realtid. Med RayStation är det här kraftfulla verktyget tillgängligt för första gången i ett dosplaneringssystem.

Dosplanering med MCO går till på följande sätt: baserat på användardefinerade kliniska kriteria skapas automatiskt en familj av så kallade paretoplaner. Paretoplanerna används i sin tur som indata till ett interaktivt navigeringsverktyg där dosfördelningen med de önsade kliniska egenskaperna visualiseras.